Die diachrone Nutzung des Heiligtums wird auf einzigartige Weise insbesondere durch die übereinander liegenden Kultgebäude im Bereich des Südtempels dokumentiert. Das älteste stammt aus mykenischer Zeit und datiert in die zweite Hälfte des 15. Jahrhunderts v. Chr. Danach folgen Gebäude mit Funden aus der späten Bronzezeit und der frühen Eisenzeit, darunter eines aus der Zeit um 700 v. Chr., in dem der Teil eines Kriegerfrieses – ein einzigartiges Beispiel der frühen Monumentalmalerei – ans Licht kam, der die Innenwand des Tempels schmückte. Der letzte Tempel ist ein kleiner Bau der frühen Kaiserzeit, der auf den Ruinen des archaischen Tempels errichtet wurde. Etwa in der Mitte des Südtempels liegt ein rechteckiger Raum klassischer Zeit, der wahrscheinlich das Allerheiligste darstellte. Im Adyton des Nordtempels wurde bei den Ausgrabungen im Jahr 1976 ein Altar mit unberührten Zeugnissen seiner letzten Nutzung entdeckt, einer im Bleiverguss eingesetzten aufrecht stehenden männlichen Figur und mehreren Votivgaben.